运能不足，矛盾突出
目前，中国化工产业处于逐步扩张的阶段，但区域发展极不平衡，以石油、天然气等为基础原料的化工产业集群大多都分布在西部，而其输出产品的销售地和下游深加工企业又多集中在东部沿海地带，“产销分离”决定了“危化物流”运输的紧俏。比如，煤化工中的“煤制甲醇”，西北地区产能占到全国总产能的65%，而当前中国甲醇运输以汽运为主，铁路运输、水运其次，在铁路路网地理分布不均衡的背景下，主要干线运输能力已经饱和，如京沪、京广、陇海、石太等线绝大部分区段货运能力利用率已达100%，其货运运能不足的矛盾非常突出。
与铁路运力紧张相比，危化品采取水路运输也面临着可选择性极小的困境，因为中国缺乏具备危化品运输资质的水运企业、水运船舶及其配载的容器短缺，长期以来导致水运效率低下。在铁路运力不足、水运容器短缺的情况下，很多企业被迫选择了汽运方式，但其运输成本较高，价格是铁路运输的2倍，水运的3倍，这给企业造成了很大的压力，同时也存在更多不可预知的风险。
仓储设施缺口巨大
近年来，中国危化品仓储建设虽不断发展，但设施总量仍不能满足行业发展的需求，仓库严重短缺，一些经济发达地区缺口达30%以上。加之仓储设施布局不合理，面向市场交易的仓库不多，公共仓库偏少，因而出现了不少地下仓库，危化品异地存放于“黑仓库”的现象十分普遍，带来了隐患。
就现实情况来看，危化品仓库的缺口还在不断增大，其原因包括：一是中国危化品产量不断增加，但同期出口量却有所减少，致使大量产品积压；二是中国部分企业盲目投资，引发结构性产能过剩，造成库满仓平。据中国化工信息部门统计，中国硫酸过剩超过25%，甲醇超过50%，黄磷超过60%，纯碱超过25%，烧碱超过30%，电石超过30%；三是危化品仓库建设标准不规范，城市土地紧缺，危化品仓库建设步履维艰，难有立足之地。
行业标准不统一，监管困难
目前，中国危化品物流市场缺乏行业标准，国内一些化工生工物流仅停留在国家法律法规所要求的层面，没有形成通行的行业标准。化工物流行业也未形成通行的自律标准和要求，化工品物流企业良莠不齐，给化工物流带来隐患。
在管理上制度缺失、管理缺位，危化品物流管理机制尚不健全。危化品物流行业同时受到公安、交通、质检、环保、卫生以及工商、税务、海关等部门的监督和管理，各部门虽都制定了推动本行业的有关法规和规定，但对于危化品物流的管理缺乏衔接，加上不同地区的监管力度和管理标准也不一样，其管理的差异性非常大。
此外，国际跨国公司的行业标准高于国内标准，使得国内有关部门通过审核和验证的车辆，在跨国企业不予认同，即中国的外企采用欧洲道路危险品运输质量评估标准，至使中国危化品物流管理标准概念模糊。
专业人才匮乏
目前，中国有5000多家企业、近10万台车辆、20多万人从事危化品运输业务，每年危化品运量达1-2亿吨，但80%以上的公司没有专业的职业培训师和鉴定师，企业的从业人员缺乏专业性，比如学物流专业的不懂危化品运输的特性，学化工专业的又不懂仓储物流的规范，尤其是高级人才极度匮乏。
从全行业来看，危化品仓储业一线保管人员中，有33.57%是农民工，他们在危险品养护、科学管理方面缺乏深度认识，只能从事简单的出入库业务及装卸搬运工作。而在一线保管员中，有70%-80%的人没有进行过正规的职业技术培训，大多只接受过企业内部简单的职业教育或岗前培训，这也给行业的发展带来弊端。
低价竞争“生态”恶化
由于危化品行业的不断发展，一些不具备资质的公司，甚至做普货的公司，也开始大量涌入危化品物流市场。这些企业往往在设备、技术、管理上不愿意进行更多的投入，有的用普通货车直接运输危化品，更有甚者，在普货中夹带危化品。
很多运输企业从自身效益考虑，槽罐混装，各种危化品共用一辆槽罐车，如装了苯酚的车再去装硫酸，除了腐蚀罐体之外，混装还可能产生爆炸。由于运营成本很低，在市场上可以用很低的运价招揽到客户。而低价竞争，不仅抢夺了正规公司的市场份额，还使整个危化品行业开始偏离合理的价格区间，严重影响了市场的正常秩序，加之相关部门执法不严，使得小部分物流公司可以通过超载、不规范操作等手法进一步压缩成本，确保利润。恶性市场竞争使危化品物流市场大有劣币驱逐良币之势。