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兽药经营许可证的有效期为五年。根据《中华人民共和国兽医管理条例》第二十三条的规定，兽药经营许可证应当载明经营范围、经营地点、有效期和法定代表人姓名、住址等事项。在有效期届满后，如果需要继续经营兽药，应当在许可证有效期届满前6个月到发证机关申请换发兽药经营许可证。
在申请兽药经营许可证时，需要准备一系列相关资料，包括兽药经营许可证申请表、营业执照复印件、法人身份证复印件、健康证复印件等。这些资料用于证明申请单位或个人的合法经营资格、兽药经营场所和设备设施情况、兽药产品的合法性和质量等。