为了使设备保持足够的换热效率，必须采取诸如增加水量等措施，同时为维修因腐蚀等原因造成的设备损坏，必然回增加费用，从而增大了设备的运行成本。
由于阻止了设备的有效换热，从而使换热面上的金属处于长期高温热负荷状态，导致金属疲劳;另一方面，腐蚀的发生会导致换热管管壁变薄，尤其是垢下腐蚀会导致设备穿孔泄漏，这些情况的发生，使得设备的使用寿命被缩短。
沉积物和微生物垢的产生，促使了浓差腐蚀电池的形成及垢下腐蚀的产生，从而使金属的腐蚀加速加剧。
沉积物与微生物黏泥覆盖在金属表面上会阻止水中的缓蚀剂、阻垢剂和杀生剂到达金属表面发生缓蚀、阻垢和的作用，并且有些微生物还会与一些水处理药剂发生反应，从而破坏和降低了这些药剂和使用效果。