共同点：
无论注册在公司名下还是个人名下，审查流程及时间都是相同的，当前审查期限约4个月左右，符合《商标法》规定的予以初步审定，反之就予以驳回。
商标注册成功后所享有的权利也都是相同的，10年到期后，若继续使用都需向商标局申请续展，期间若遇到商标撤销三年不使用或无效宣告，都需要依法答辩，否则有可能就无效了。
不同点：
1、资料不同
推定委托代理机构提交为例
个人：身份证+个体执照+委托书+标样；身份证、个体执照、委托书都需申请人签字。
公司：营业执照+委托书+标样；营业执照、委托书需加盖公章
2、稳定性不同
若以公司名义申请，则公司变更地址、名义后，商标也需要同步变更。尤其是公司被注销后，商标转让或移转要求较为严格。
而以个人名义申请的，众所周知身份证一般情况下，自然人生前很少变更，相对于公司申请来说较为稳定。
3、财产属性不同
若注册在个人名下，属于个人财产，若发生意外，继承人可以依法继承；
若注册在公司名下，属于公司资产，公司在注销前，需要把商标转让给其他组织或自然人名下，一旦注销后办理移转需要有确定的承继文件。
企业：
①企业地址名称任何信息出现变动，商标都要申请变更；
②公司注销，商标也不存在了；
③商标使用证据容易取证；
个人：
①个人申请需要办理个体工商户营业执照；
②商标在个人名下会有财产权的问题；
③个人商标可以许可给企业使用；
④个人商标的使用证据不易取证，容易被“撤三”；
⑤商标申请时，注册范围必须和个体工商执照上的业务相关。
所以，个体工商户或个人独资企业更适合以个人名义申请注册商标，而多股东的企业，就更适合以公司的名义申请注册商标。
无论是以个人名义申请还是企业名义申请，费用都是相同的。
《商标法》规定：许可人应当监督被许可人使用其注册商标的商品质量。
被许可人应当保证使用该注册商标商品的质量。经许可使用他人注册商标的，必须在使用该注册商标的商品上标明被许可人的名称和商品产地。