CNC加工和车床加工不同，加工中心加工时由于工具转动，便不可能在加工中及时掌握刀尖的情况来调节进刀量等。也不可能象数控车床那样可以只调节数控按扭就可以改变加工直径。这便成了完全自动化加工的一个很大的障碍。也正因为加工中心不具有自动加工直径调节机能(附有U轴机能的除外)，就要求镗刀必须具有微调机构或自动补偿机能，特别是在精镗时根据公差要求有时必须在微米级调节。
加工中心镗孔时由于切屑的流出方向在不断地改变，所以刀尖、工件的冷却以及切屑的排出都要比车床加工时难的多。特别是用立式加工中心进行钢的盲孔粗镗加工时，至今这个问题还没得到完全解决。
CNC加工文件的程式单要正规化，包括模号、名称、程式名、加工内容、刀具大小、进刀量、特别是刀具装夹长度、每条程式的预留的余量、光刀，要注明清楚，R面与平面要接顺的地方，要在程式单上注明，操作员在加工时要提高0.02～0.05MM先加工，锣了几刀时停掉看看是否接顺，用手摸下是否起级，若不顺时再降下锣。
CNC数控车床加工的重复性投产的零件:使用数控磨床的工序准备工时占有较高的比例。例如 工艺分析准备、编制程序、零件首件调整试切等，这些综合工时的总和往往是零件单件加工工时的几十倍到上百倍，但这些数控车床工作内容都可以保存起来反复使用，所以一种零件在数控磨床上试制成功再重复投产时，生产周期大大减少，花费也少，能取得更好的经济效益。