很多化学肥料还趋向于制成流体肥料，并在其中掺入微量元素肥料和农药，成为多功能的复合肥料，便于管道运输和施肥灌溉（喷灌、滴灌）的结合，有省工、省水和省肥的优点。
按肥料的化学性质，可分为化学酸性、化学碱性和化学中性肥料。按肥料被植物选择吸收后对土壤反应的影响，可分为生理中性、生理碱性和生理酸性肥料。按肥料中养分对植物的有效性，可分为速效、迟效和长效肥料。
由于一种肥料常有多种属性，除上述分类外，还有常见的其他分类方法：按肥料物理状态可分为固体和流体肥料。固体肥料又分为粉状和粒状肥料。流体肥料是常温常压下呈液体状态的肥料。
植物生长发育必需16种元素，但对其需要量有很大差别，习惯上把碳、氢、氧、氮、磷、钾、钙、镁、硫称为大量元素；把需要量少的，含量在0.01%以下的其余7种元素称为微量元素。