有干货集装箱（DRY CONTAINER）、散货集装箱（BULK CONTAINER）、液体货集装箱、冷藏箱集装箱，以及一些特种专用集装箱，如汽车集装箱、牧畜集装箱、兽皮集装箱等。
杂货集装箱是是最普通的集装箱，主要用于运输一般杂货，适合各种不需要调节温度的货物使用的集装箱，一般称通用集装箱。
散货集装箱是用以装载粉末、颗粒状货物等各种散装的货物的集装箱。
液体货集装箱是用以装载液体货物的集装箱。
冷藏集装箱是一种附有冷冻机设备，并在内壁敷设热传导率较低的材料，用以装载冷冻、保温、保鲜货物的集装箱。
汽车集装箱是一种专门设计用来装运汽车，并可分为两层装货的集装箱。
牲畜集装箱（PEN CONTAINER）是一种专门设计用来装运活"牲畜的集装箱，有通风设施，带有喂料和除粪装置。
兽皮集装箱是一种专门设计用来装运生皮等带汁渗漏性质的货物，有双层底，可存贮渗漏出来的液体的集装箱。
按用途分
有冷冻集装箱（REEFER CONTAINER），简写RF，挂衣集装箱（DRESS HANGER CONTAINER），开顶集装箱（OPEN TOP CONTAINER）简写OT，框架集装箱（FLAT RACK CONTAINER）简写FR，罐式集装箱（TANK CONTAINER）简写TK、冷藏集装箱、平台集装箱（PLATFORM CONTAINER）、通风集装箱（VENTILATED CONTAINER）、保温集装箱（INSULATED CONTAINER）。
集装箱计算单位，简称：TEU，是英文Twenty Equivalent Unit的缩写， 又称20英尺换算单位，是计算集装箱箱数的换算单位。也称国际标准箱单位。通常用来表示船舶装载集装箱的能力，也是集装箱和港口吞吐量的重要统计、换算单位。
各国大部分集装箱运输，都采用20英尺和40英尺长的两种集装箱。为使集装箱箱数计算统一化，把20英尺集装箱作为一个计算单位，40尺集装箱作为两个计算单位，以利统一计算集装箱的营运量。
在统计集装箱数量时有的一个术语：自然箱，也称"实物箱"。自然箱是不进行换算的实物箱，即不论是40英尺集装箱，30英尺集装箱，20英尺集装箱或10英尺集装箱均作为一个集装箱统计。