专为运输要求保持一定温度的冷冻货或低温货而设计的集装箱。它分为带有冷冻机的内藏式机械冷藏集装箱和没有冷冻机的外置式机械冷藏集装箱。适用装载肉类、水果等货物。冷藏集装箱造价较高，营运费用较高，使用中应注意冷冻装置的技术状态及箱内货物所需的温度。
制冷加热集装箱
制冷加热集装箱是指设有制冷装置（机械式制冷或耗用制冷剂制冷）和加热装置的冷藏集装箱。这种集装箱不仅有制冷装置，而且具有加热装置，可以根据需要采取制冷或加热手段，使冷藏集装箱内的温度控制在所设定的范围内，一般箱内控制温度范围为一18℃～38℃。
冷藏集装箱运送冻结货时通常使用温度应不高于-18℃。通常英尺冷冻集装箱，平均降温速度为31.3℃ /h（空箱）；但装货后，由于货物热容量较大，降温速度会大大减慢，有时达到设定温度要求需要15-16h。若进货温度较高，则达到设定温度需要2-3d。
根据ISO/TC-104 668 Dimensions and ratings标准的规定，按照集装箱的长度，集装箱可以分为10‘，20’，30‘，40’，45‘，30’集装箱一般不使用，使用最多的长度尺寸为20‘和40’的集装箱，而且生产制造的集装箱95%以上为长度40'的集装箱。最近几年，45‘集装箱的使用越来越多，所以在2005年换版时把该尺寸的集装箱加入了该标准。