指纹考勤是最近几年发展起来的新技术，目前使用在高新机密企业比较多，在普通公司还没被大量采用。
指纹式考勤机工作原理：利用每个人的指纹互不相同的道理，建立指纹库，把每个员工的指纹和名字等员工信息挂钩。员工上下班都必须按指纹，指纹考勤机把所收集的指纹和指纹库对比，再对相应指纹记录的员工进行记录考核。
考勤机分两大类：第一类是简单打印类，打卡时，原始记录数据通过考勤机直接打印在卡片上，卡片上的记录时间即为原始的考勤信息，对初次使用者无需做任何事先的培训即可立即使用；第二类是存储类，打卡时，原始记录数据直接存储在考勤机内，然后通过计算机采集汇总，再通过软件处理，最后形成所需的考勤信息或查询或打印，其考勤信息灵活丰富，对初次使用者需做一些事先培训才能逐渐掌握其全部使用功能。
生物指纹/虹膜类考勤机，进入市场3-4年，规模量产的少，试验机型多，零售价位从指纹考勤机6000-20000元到虹膜考勤机数万元之间。主要优点是无需携带卡，能杜绝，没有卡片损耗。缺点是指纹考勤机超过几百人使用时，处理时间较其它打卡方式慢数倍。同时在静电干扰、汗液盐分、其它赃物、手指磨损、贴近角度或压力不当时，采集头很难读取指纹，轻者识别效率低，重者识别失败。虹膜考勤机则受到硬件小型化和价格的限制，其主要用途仍限于重要区域的门禁管制、银行金库、保险箱等特殊领域
由于指纹考勤机需预先存入员工的指纹信息库，而指纹信息涉及到个人隐私，企业无权强行录入员工的指纹信息。 人脸识别考勤机内置摄像头可在刷卡的同时对刷卡者进行拍照存档, 让者无所遁形.速度快，刷卡+拍照1秒内完成。采用超大容量存贮器。即拍即存。 不涉及到个人隐私。人脸识别考勤机采用内置拍照摄像装置和芯片，使其性能更卓越，价格虽然比较指纹考勤机高一点，但其性能是不容被忽视的。